负责个旧市辖区内疫情信息（收集、整理、分析、报告）、流行病学调查、隔离防控等日常工作。统一承担公共卫生、医疗卫生监督执法，强化医疗机构传染病防控巡查。负责突发公共卫生事件和灾害疫情的现场处置、风险评估、疫情控制与卫生防护。承担全市传染病、寄生虫病、地方病、非传染性疾病等的预防控制（其他局属医疗卫生机构承担的疾病防控除外），组织实施管理全市免疫规划工作；负责疫情及健康相关因素（食源、职业、放射、环境等疾病）监测、评价、干预和信息管理，开展公众健康及营养状况监测评价。开展疾病病原生物检测鉴定、理化因子检测评价，提供技术指导、培训与应用研究。协同局属医疗卫生机构开展健康教育活动。依据法律法规，受委托承担传染病防治、公共场所卫生、生活饮用水、餐饮具消毒、学校卫生、职业卫生、放射卫生、妇幼健康、医疗卫生机构、采供血、托育托幼、消毒产品等领域的监督检查与违法查处。承担卫生行政许可办理、卫生执法法制监督与法治建设、“双随机、一公开”监督抽查、投诉举报调查处理及维稳工作，负责卫生监督信息管理与法制宣传培训。