负责农业领域检疫、检验检测、认证的技术性工作；负责动植物疫病预防控制工作；负责为农业生态环境保护提供监测保障，对农业生产环境（含土情、肥情、土壤疫情、土壤养分、有害物质及农用水、养殖水等）实施质量检测；农药、化肥、有机肥等农业生产投入品的成分测定分析；对动、植物源性农产品的重金属、农药、兽药、违禁药残留物检测；负责"三品一标"（无公害农产品、绿色食品、有机农产品、农产品地理标志）的认证申报及日常事务性工作；负责动物疫病监测、诊断、净化、防控技术指导，组织生物制品供应和防疫物资储备；协助机关依法开展植物检疫，植物有害生物疫情普查、检测及疫情监督销毁工作。