牢牢把握铸牢中华民族共同体意识工作主线，将之贯穿于疾病预防控制、卫生健康监督工作及自身建设等全过程、各方面。为机关提供支持保障，为全旗人民身体健康提供防疫保障。疾病监测、疾病防治研究、疾病预防与控制、检验检测、食源性疾病监测、免疫规划管理、从业人员健康检查、工业有害毒物评价与职业危害因素监测；突发公共卫生事件预警与处置、卫生宣传与健康教育；依法开展医疗卫生、学校卫生、公共场所、职业卫生等监督检查工作，查处违法行为；是全旗急慢性传染病、传染病卫生应急、慢性非传染病、地方病及职业病等业务技术指导中心。