1、负责甘肃省玛曲青藏高原土著鱼类省级自然保护区内水生野生动物资源管理、病虫害防治、珍稀水生野生动物的抢救、放养等；制定和实施保护区渔业资源保护与开发发展规划。2、开展生物多样性保护的科研和监测及增殖放流等工作；负责保护区的科学研究、学术交流、标本管理等工作。3、加强与州、县公安部门的联系，负责保护保护区渔业资源、保护区的治安、案件管理，调解处理渔业生产纠纷，保护渔业水域环境。4、打击非法捕捞和各种违法违规行为，保护珍贵水生动物和重要的水生植物；维护渔业生产的正常秩序，协助有关部门处理渔业生产纠纷。5、根据《渔业法》的有关规定，征收和管理渔业资源增殖保护费；开展渔业船舶的检验。