维护渔业生产秩序，保护秦岭细鳞鲑等水生野生动物资源，维护生态平衡。秦岭细鳞鲑及生态环境保护、秦岭细鳞鲑驯养繁殖及科学研究、秦岭细鳞鲑栖息地环境监测与治理、秦岭细鳞鲑资源基础数据收集分析、自然保护宣传教育、保护区内生态旅游管理、渔业生产秩序维护及技术指导、渔船安全检测、水产品检疫及水产品质量监管。