承担河套灌区生态安全、灌区节水、盐碱地改良、建设现代化灌区的技术支撑、科研院校合作任务、灌区水利科研人才培养、新技术、新材料、新设备引进推广、科技成果推广示范应用、配合完成河套灌区现代化农牧业建设科研任务、协助开展科研项目的申报组织实施、指导分中心试验站科研工作、内蒙古河套灌区水利发展中心交办的其他相关工作。