承担农业微生物学基础科学研究和应用研究；承担微生物菌种资源的采集、引进、保藏、共享、菌种鉴定及功能评价；为湖南农业生物产业发展提供建议与咨询；为湖南种植业、养殖业等行政业务提供技术支撑；承担农业微生物技术普及、示范推广与农户培训等公益服务；承担农业微生物科技成果转化、孵化、引进；开展农业检测分析、农产品质量安全风险评估。