负责贯彻实施有关法律、法规、规章和规范性文件；协调、处理港航之间从事琼州海峡轮渡运输中的纠纷；定期公布海峡轮渡调度班期，组织、指导港航企业做好车船衔接、疏运工作，维护海峡运输秩序；根据海峡轮渡运输的实际情况，提出加强运输管理的措施，报广东、海南两省交通行政主管部门批准后实施；根据省交通行政主管部门的委托，依法查处违反海峡运输市场管理规定的行为。