负责生态环境质量监测、调查评价和考核，承担监测网络建设、运行、考核、点位调整；负责环境监测质量控制与管理，负责兵团重点监控企业在线监测设备的联网、传输；对兵团其他监测机构、各师市污染源监控工作给予技术指导和支撑；承担生态环境质量监测新技术、新方法以及监测技术体系的研究工作。