负责制定、修订动物疫情专项应急预案；组织开展动物疫情预防、监测和预警；协调指挥部成员单位开展应对动物疫情的相关工作；收集、整理、上报动物疫情信息；指导县级指挥部做好动物疫病防治工作；承担动物疫病的诊断、检测、流调、疫情报告、技术指导工作；负责起草、下发相关防控重大动物疫病工作文件、通知、技术规程等；负责组织、协调、实施重大动物疫病预防、控制和扑灭；负责防控重大动物疫病工作目标责任制的落实和督查；承担预防、扑灭动物疫病所需生物制品的组织供应及应急物资储备工作；承担动物、动物产品检疫及病死动物、动物产品的无害化处理技术指导，动物、动物产品检疫证明标识管理、发放。