完成国家、省、州重大疾病预防控制指令性任务，制订本地区疾病预防控制和应急处置预案、技术方案。传染病疫情监测预警；疫情及健康相关因素信息化管理；疾病监测，收集、报告、分析和评价疾病与健康危害因素等公共卫生信息。突发公共卫生事件现场处置；对急性传染病、消毒及病媒生物、艾滋病、结核病、麻风病、血源及性传播疾病、自然疫源性疾病、寄生虫病等的防控。国家免疫规划管理。地方病、慢性非传染性疾病防治；特定人群职业健康监护及健康危害因素监测与干预；食源性等疾病监测评价和流行病学调查；健康和营养状况监测与评价、干预策略与措施。病原微生物检测、鉴定和基因测序；危害因素检验鉴定；生活饮用水水质监测、食品安全风险监测；实验室生物安全技术指导评估。健康教育与健康促进，健康科普、爱国卫生运动宣传指导。对医疗卫生机构及从业人员执业活动、公共场所、学校、生活饮用水供管水单位、消毒产品、餐饮具集中消毒服务单位、职业健康检查机构、职业卫生技术服务机构及有职业危害因素的单位等监督检查，查处违法行为。受理投诉举报，打击非法行医、非法采供血等违法行为。对下级疾病预防控制机构指导、督查、培训和考核，指导医疗卫生机构公共卫生工作。