开展微生物学科研究，为“三农”建设提供科技支撑。主要承担微生物资源多样性研究与前期开发，重要微生物及其产物检测和开发利用，农业有害微生物的鉴定与防控技术研究，食用、药用真菌研究与加工，菌种生产、新品种引进及推广等相关业务。