承担微生物种质资源保护、功能改造和利用等公益性科研工作；围绕生命与健康、资源与环境，在微生物资源、微生物学、微生物药物学等研究领域，开展微生物技术创新、微生物制造与应用等基础性、应用基础性及前瞻性研究；为社会提供相关技术开发、技术转化、技术咨询和技术服务等。