阻遏动植物疫病省际传播，预警防控有害生物，保障农牧业生产安全。宣传、贯彻、落实各种动植物检疫法规；负责辖区内进出新疆动植物、动植物产品和其他检疫物及其装载容器、木质包装的检验检疫及监督管理，对动植物检疫处理工作进行监督管理；依法及时查处无动植物检疫证书调运动植物、动植物产品和其他检疫物的违法行为；负责辖区内进出新疆动植物病虫害的疫情监测及有关疫情信息的收集和上报。