将中日友好医院云南医院打造成为国内领先，为云南及周边地区、南亚东南亚患者提供高质量、全方位的呼吸系统疾病诊疗服务，负责预防保健、临床医疗、科研教学、人才培养、健康教育、对口支援、突发公共卫生事件的医疗救治任务等工作，承担区域内疑难危重症的诊断与治疗、医学人才培养及医学科学研究等工作。