承担全州农产品质量安全监管工作；参与拟定农产品质量安全体系、农业标准体系、检验监测体系、认证认可体系的建设规划和项目计划；承担全州无公害农产品基地认定、产品认证的监管和审核工作；农业环境条件监测、农业投入品质量检测、农产品品质和安全指标检测；无公害农产品、绿色食品和有机农产品基地及产品的认证检测；负责全州县级检测站进行技术培训与业务指导；承担省、州下达的例行检测任务；研究拟定甘孜州绿色食品发展规划，开发甘孜州绿色食品，建立甘孜州绿色食品基地，承担省绿色食品中心委托的工作；承担海螺沟农产品质量安全工作。贯彻落实党中央和省委、州委关于有机农业工作的方针政策和决策部署。一是制定全州“三品一标”发展规划并组织实施；二是制定“三品一标”生产技术规程和管理技术规范；三是负责“三品一标”宣传培训、品牌培育、技术推广等工作；四是指导“三品一标”申报和有机农产品基地、绿色食品原料标准化生产基地建设；五是承担“三品一标”质量安全监督管理行政辅助工作。