负责重点保护长江安徽段水生野生动物栖息环境，恢复和建立国家一、二级保护水生野生动物的繁殖洄游通道；收容救治白鳍豚、江豚等国家一、二级重点保护水生野生动物；开展水生野生动物的科学研究，建立长江安徽段水生野生动物保护信息网络，提供技术咨询和信息服务。