承担广州市生态环境质量监测工作;承担省生态环境监测中心和省环境辐射监测中心指令性监测任务;受属地生态环境行政主管部门管理开展污染源、执法、应急等监测工作;承担跨区域（流域、海域）非常规项目及特征污染物监测，开展跨区域（流域、海域）较大突发环境事件应急监测和污染纠纷仲裁监测;开展珠三角区域大气环境质量、西江流域水环境质量和珠江口西部海域海洋生态环境质量的监测调查与分析研判工作;对广州市各级生态环境监测机构进行业务指导。