承担疾病预防控制相关工作，负责凉山州疾病预防控制、监测检测（健康危害因素监测与干预、实验室检测分析与评价）；负责突发公共卫生事件应急处置、疫情报告及健康相关因素信息管理；负责全州各级医疗、疾控机构以艾滋病为主的重大传染病及新突发传染病的防治指导培训、科研教学；负责全州人民群众健康宣传教育等；负责监测预警体系的建设和运行维护；承担公共卫生、医疗卫生（含中医药）、职业与放射、消毒和传染病防治等监督执法工作；完成主管部门交办的其他工作。