负责组织实施全区水运建设项目；参与水运发展规划、港口规划、航道规划；负责编制水上应急能力规划、水运环保规划；负责水上应急能力建设、航道养护等涉及事务性工作；负责水上交通应急事件救援救助、船舶打捞、水上搜救、技术鉴定等事务性工作；负责水路运输市场及港口运营、船舶修造、水运行业统计等事务性工作。