运用中藏医药理论技术，开展藏医医疗服务为人民防病治病，担负中藏医药人员培训、复训、进修提高等教学任务和中藏医药科研任务，指导全州中藏医药业务工作。负责抢救挖掘整理藏医药古籍文献和民间诊疗技术，开展藏医药基础研究，以及高原病疑难杂症的研究和藏药新药的研制、传统配方的疗效验证，承担藏医药适宜医疗技术推广培训，宣传藏医药文化等职责。