直接管理抚仙湖星云湖杞麓湖（简称三湖）。贯彻执行三湖保护条例及有关法律法规；制定三湖保护管理措施；审查三湖径流区相关规划并监管；负责三湖一级保护区综合行政执法；监督沿湖三县区履行涉湖保护管理职责；实施取水许可制定渔业捕捞计划登记检验渔业船舶负责非机动船总量控制；征收水资源费资源保护费渔业资源增殖保护费。